昌平区医院始建于1957年，是一所集医疗教学科研预防为一体的综合医院。

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2004年底，全国首座安装了高级防弹玻璃窗德国进口防滑地板，无“铁窗”式防护栏的精神病人住院大楼在这里正式启用全院共设置病床1369张，是北京市卫生局直属三级甲等医院，是北京市唯一收治精神疾病合并肝炎结核或内科疾病。